Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFBP38117 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFBP38117 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms