Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCR1P32246 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms