Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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