Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms