Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms