Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms