Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
GCSHP23434 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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