Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF6P18850 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF6P18850 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms