Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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