Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-EP13747 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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