Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM10L2BP0DMW5 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms