Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms