Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms