Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TO15178 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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