Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms