Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
USP17L23D6RBM5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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