Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP17L11C9JVI0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP17L11C9JVI0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms