Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms