Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms