Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms