Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms