Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms