Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEU3Q9UQ49 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms