Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms