Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms