Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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