Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms