Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS1Q9NYS0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS1Q9NYS0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS1Q9NYS0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS1Q9NYS0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKIRAS1Q9NYS0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms