Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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HOXC10Q9NYD6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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