Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms