Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms