Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms