Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms