Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms