Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms