Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.6 ms