Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms