Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF496Q96IT1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms