Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL2Q92772 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL2Q92772 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL2Q92772 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms