Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ANKRD42Q8N9B4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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ANKRD42Q8N9B4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ANKRD42Q8N9B4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ANKRD42Q8N9B4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ANKRD42Q8N9B4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ANKRD42Q8N9B4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD42Q8N9B4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ANKRD42Q8N9B4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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