Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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