Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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