Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms