Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMBQ6PCB8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms