Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms