Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms