Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LILRB2-203ENST00000391748 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC022596.2-201ENST00000635352 3078 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CDH4-201ENST00000543233 3117 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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ANKRD39Q53RE8 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC027682.7-201ENST00000623147 2121 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC021087.3-201ENST00000565521 2881 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 Z95114.2-201ENST00000623490 2205 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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