Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms