Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms