Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms